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生物芯片類試劑生產(chǎn)及質(zhì)量控制技術(shù)指導(dǎo)原則
 

附件6:

體外診斷試劑生產(chǎn)及質(zhì)量控制技術(shù)指導(dǎo)原則

——生物芯片類試劑生產(chǎn)及質(zhì)量控制技術(shù)指導(dǎo)原則

(征求意見稿)

前   言

本指導(dǎo)原則所定義的生物芯片診斷試劑是指將多個生物探針(包括DNA片段,寡核苷酸、抗原、抗體,組織,細(xì)胞等)按預(yù)先設(shè)計的排列方式固定在特制的基質(zhì)(包括玻璃片,尼龍膜,硝酸纖維素膜等)上,用特定的方法提取生物靶分子并進(jìn)行標(biāo)記,然后與固定在基質(zhì)上的生物探針特異性的結(jié)合,再用相應(yīng)的檢測設(shè)備(如激光掃描儀、CCD檢測儀等)和分析方法(包括軟件)進(jìn)行檢測、記錄、分析,實現(xiàn)對生物靶分子的定性或定量檢測的試劑。

根據(jù)芯片制作的主要原料和方法,生物芯片可分為核酸芯片、蛋白芯片、細(xì)胞芯片、組織芯片、芯片實驗室等。本指導(dǎo)原則是針對核酸和蛋白為檢測靶分子生物芯片的生產(chǎn)及質(zhì)量控制技術(shù)指導(dǎo)原則,其它類型靶分子檢測的芯片診斷試劑可參考本指導(dǎo)原則。

由于生物芯片技術(shù)還在不斷發(fā)展,國家食品藥品監(jiān)督管理部門可依據(jù)科學(xué)技術(shù)發(fā)展的需要,適時組織對本指導(dǎo)原則進(jìn)行修訂。

一、基本原則

(一)生物芯片診斷試劑生產(chǎn)用的物料包括:原料,輔料和包裝材料。各種物料應(yīng)當(dāng)制定相應(yīng)的質(zhì)量指標(biāo),并應(yīng)符合有關(guān)法規(guī)的要求。

(二)生物芯片診斷試劑的生產(chǎn)企業(yè)應(yīng)具備相應(yīng)的專業(yè)技術(shù)人員,相適應(yīng)的儀器設(shè)備和生產(chǎn)環(huán)境,獲得《醫(yī)療器械生產(chǎn)許可證》;應(yīng)當(dāng)按照《體外診斷試劑生產(chǎn)實施細(xì)則(試行)》的要求建立相應(yīng)的質(zhì)量管理體系,形成文件和記錄,加以實施并保持有效運(yùn)行;應(yīng)當(dāng)通過《體外診斷試劑生產(chǎn)企業(yè)質(zhì)量管理體系考核評定標(biāo)準(zhǔn)(試行)》的考核。

(三)生物芯片診斷試劑的研制應(yīng)當(dāng)按照科學(xué)、規(guī)范的原則組織研發(fā),各反應(yīng)條件的選擇和確定應(yīng)符合基本的科學(xué)原理。

(四)生物芯片診斷試劑生產(chǎn)過程中所用的物料及工藝,應(yīng)充分考慮可能涉及的安全性方面的事宜。

二、物料質(zhì)量控制

(一)核酸檢測芯片

核酸芯片檢測時,從生物樣本中提取的核酸可用熒光標(biāo)記、金標(biāo)記和酶標(biāo)記。檢測方法包括光譜學(xué)方法和化學(xué)顯色。下面為熒光標(biāo)記芯片技術(shù)指導(dǎo)原則,采用金標(biāo)記和酶聯(lián)顯色等的生物芯片診斷試劑可參照核酸芯片和蛋白芯片相關(guān)部分。

1、主要生物原料

核酸檢測芯片的主要生物原料包括模板DNA、dNTPs、引物、探針、標(biāo)記物等。應(yīng)按照工藝要求對這類生物原料進(jìn)行質(zhì)量檢驗,以保證其達(dá)到規(guī)定的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)。主要生物原料的供應(yīng)商要求相對固定,不得隨意變更供應(yīng)商。

(1)模板DNA

重組DNA:經(jīng)測序驗證,關(guān)鍵位置沒有錯誤。1×TE溶解,濃度為1μg/μl以上,-20℃保存。

(2)dNTPs(dATP/dUTP/dGTP/dCTP/dTTP)

HPLC純,PCR級,無DNase、RNase污染。-20℃以下保存。外購者,由生產(chǎn)廠家提供質(zhì)量保證證明,達(dá)到生產(chǎn)要求。

(3)引物

序列確證;進(jìn)行PCR擴(kuò)增后,克隆測序鑒定驗證,建立引物標(biāo)準(zhǔn)品。生產(chǎn)中的引物原材料為凍干粉,PAGE純或HPLC純,外購者,供應(yīng)商應(yīng)提供該產(chǎn)品的質(zhì)檢證明,如PAGE電泳結(jié)果或HPLC分析圖譜;自己合成的引物,需有PAGE電泳結(jié)果或HPLC分析圖譜。用標(biāo)準(zhǔn)DNA模板擴(kuò)增,電泳檢測,譜帶單一,大小正確,與對照引物比較,產(chǎn)物量一致。符合視為合格引物。-20℃以下保存。

(4)探針(用于陣列制備)

重組DNA, 凍干粉(或1×TE溶解液):每種90μg以上,酶切鑒定分析圖譜。

PCR產(chǎn)物,凍干粉(或1×TE溶解液):每種90μg以上,PCR電泳鑒定圖譜。

合成寡核苷酸:PAGE純或HPLC純,每種90μg以上,提供該產(chǎn)品的PAGE電泳分析圖譜或HPLC分析圖譜。外購者,供應(yīng)商應(yīng)提供質(zhì)量保證證明,達(dá)到生產(chǎn)要求。

探針序列的正確性:應(yīng)用克隆鑒定的標(biāo)準(zhǔn)DNA雜交鑒定或進(jìn)行測序鑒定。外購者,供應(yīng)商應(yīng)提供質(zhì)量保證證明,達(dá)到生產(chǎn)要求。

純度和濃度檢測:用電泳方法,電泳圖譜沒有雜帶,目標(biāo)條帶的強(qiáng)度與已知濃度的標(biāo)準(zhǔn)DNA條帶進(jìn)行參比計算其強(qiáng)度。純度較高的DNA,可用紫外分光光度計進(jìn)行定量。檢定合格后入庫。避光、-20℃以下保存。

(5)標(biāo)記物

含有激發(fā)光波長和發(fā)射光波長介于280~680nm的所有熒光分子,HPLC純,供應(yīng)商應(yīng)提供質(zhì)量保證證明。

(6)Taq DNA聚合酶

SDS-PAGE 檢測,純度>95%,具DNA聚合酶活性,無核酸外切酶活性及核酸內(nèi)切酶活性,具熱穩(wěn)定性,94℃1小時后仍保持50%活性,由供應(yīng)商提供質(zhì)量保證。-20℃保存。

(7)UNG(尿嘧啶糖基化酶)

具尿嘧啶糖基化酶活性,無核酸外切酶及核酸內(nèi)切酶活性。1U UNG 37℃處理3分鐘后,103拷貝以下含U模板被降解后,不能產(chǎn)生擴(kuò)增產(chǎn)物,供應(yīng)商提供質(zhì)量保證。-20℃保存。

(8)RT 酶

具有逆轉(zhuǎn)錄活性,供應(yīng)商提供質(zhì)量保證。-20℃保存。

(9)RT-PCR酶

具逆轉(zhuǎn)錄酶活性和DNA聚合酶活性,無核酸外切酶活性及核酸內(nèi)切酶活性,具熱穩(wěn)定性,94℃1小時后仍保持50%活性。-20℃保存。

(10)緩沖液

各類酶制品需要的的反應(yīng)緩沖液由廠家隨酶制品提供,供應(yīng)商提供質(zhì)量保證。-20℃保存。

2、主要生物輔料

(1)雜交液

購買成品者,供應(yīng)商提供質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn),并按要求保存。自制雜交液,按半成品檢定標(biāo)準(zhǔn)要求進(jìn)行檢定。

(2)酶類

蛋白酶、核酸酶等,供應(yīng)商提供質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn),并按要求保存。

(3)核酸提取試劑

供應(yīng)商提供質(zhì)量保證,并按要求保存。如果是自制提取液,按半成品檢定要求。

(4)魚精DNA

供應(yīng)商提供質(zhì)量保證,并按要求保存。

(5)封閉用蛋白

包括牛血清白蛋白,奶粉等,提供質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn),并按要求保存。

3、主要化學(xué)原輔料

參照《中國生物制品主要原輔材料質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)(2000年版)》分析純級別進(jìn)行檢驗。主要的檢測指標(biāo)包括:溶液外觀、一般鹽類檢測、溶液pH值檢測、溶解情況檢測、干燥失重的檢測、熾灼殘渣等。

主要化學(xué)原材料的供應(yīng)商要求相對固定,不得隨意發(fā)生變更?;瘜W(xué)原材料在購入時,原材料的生產(chǎn)商必須提供該批次化學(xué)原材料的質(zhì)量質(zhì)量保證材料和質(zhì)量檢驗報告,其質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)應(yīng)達(dá)到生產(chǎn)所需的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)。

(1)無機(jī)類

主要包括氯化鈉、氫氧化鈉、純化水等。

(2)有機(jī)類

主要包括有丙酮、乙醇、枸櫞酸、吐溫20、乙二胺四乙酸二鈉、氨基吡啉等。

(3)特殊化學(xué)原料

聚乙二醇,多聚賴氨酸,丙烯酰胺,甲叉雙丙烯酰胺,N,N,N',N'-四甲基二乙胺(TEMED)、溴化乙錠(EB)、染色劑等。

4、其他物料

(1)載玻片

外觀:明亮處用肉眼觀察無缺刻,無劃傷等。規(guī)格按設(shè)計要求。

激光掃描儀掃描(波長為芯片檢測波長):包被層基本均勻。

(2)試管、吸頭、試劑瓶等

一次性使用,由生產(chǎn)廠家提供質(zhì)量保證,達(dá)到設(shè)計要求。

(3)其他:說明書、包裝外盒等

參照國家食品藥品監(jiān)督管理局頒布的《體外診斷試劑說明書編寫指導(dǎo)原則》和《醫(yī)療器械說明書、標(biāo)簽和包裝標(biāo)識管理規(guī)定》執(zhí)行。

(二)蛋白檢測芯片

1、主要生物原料

與生產(chǎn)的產(chǎn)品質(zhì)量最密切相關(guān)的生物原料包括各種活性抗原、重組抗原、單克隆杭體、多克隆抗體以及多肽類生物原科。這類原料可用于點(diǎn)膜、標(biāo)記相關(guān)酶、納米金、光學(xué)基團(tuán)及中和反應(yīng)用抗原或抗體等。使用前應(yīng)按工藝要求對這類生物原料進(jìn)行質(zhì)量檢驗,以保證其達(dá)到規(guī)定的質(zhì)量要求。主要生物原料若為企業(yè)自己生產(chǎn),其工藝必須相對穩(wěn)定;若購買,其供應(yīng)商要求相對固定,不能隨意變更供應(yīng)商,如果主要原料(包括工藝)或其供應(yīng)商有變更,必須進(jìn)行原料驗證,并進(jìn)行補(bǔ)充申報。

主要生物原料的常規(guī)檢驗項目一般包括:

(1)外觀

肉眼觀察,大部分生物原料為澄清透明的液體,不含異物,渾濁或搖不散的沉淀;或者為白色粉末,不含有其他顏色的雜質(zhì);特殊生物原料應(yīng)具備相應(yīng)外觀標(biāo)準(zhǔn)。

(2)純度和分子量

主要通過SDS-PAGE電泳和電泳結(jié)果掃描儀進(jìn)行檢測,也可用其他適宜的方法,如高效液相法等。作為免疫診斷試劑用生物原材料,用銀染法染色后,純度一般都要大于90%;用考瑪氏亮藍(lán)染色后;純度一般都要大于95%。SDS凝膠電泳法測定分子量。

(3)蛋白濃度

蛋白濃度可通過Lowry法、280nm光吸收法、雙縮脲方法等進(jìn)行檢測;

(4)效價

效價的測定一般根據(jù)蛋白含量測定結(jié)果通過倍比稀釋法進(jìn)行。效價應(yīng)達(dá)到設(shè)計規(guī)定的要求。

(5)功能性實驗

功能性實驗是指生物原料用于試劑盒試劑實際生產(chǎn)中的情況,一般考查該原料使用后的試劑靈敏度、特異性和穩(wěn)定性。

2、主要生物輔料

生物輔料指的是在生產(chǎn)過程中作為蛋白保護(hù)劑用途的一類生物原料,主要包括小牛血清、山羊血清、牛血清白蛋白和酪蛋白等。這些生物原料均應(yīng)按照《中國生物制品主要原輔材料質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)(2000年版)》所規(guī)定的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)要求進(jìn)行檢驗,達(dá)到相應(yīng)的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)后方應(yīng)用于生產(chǎn)。

生物輔料的供應(yīng)商同樣要求相對固定,不得隨意變更供應(yīng)商。

對于小牛血清或山羊血清、牛血清白蛋白以及酪蛋白等,還應(yīng)進(jìn)行功能性實驗,即以其為原料配制10%濃度的稀釋液作為樣品,進(jìn)行酶聯(lián)免疫測定,均不得出現(xiàn)非特異性反應(yīng)。

對于標(biāo)記用酶,應(yīng)在產(chǎn)品的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)中明示所使用的標(biāo)記用酶的名稱(如辣根過氧化物酶、堿性磷酸酶等),同時應(yīng)根據(jù)不同生產(chǎn)廠家的檢定方法和質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行檢驗,酶的純度RZ值(OD403nm/OD280nm)應(yīng)大于3.0。

3、化學(xué)原輔料

參照《中國生物制品主要原輔材料質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)(2000年版)》分析純級別進(jìn)行檢驗。主要的檢測指標(biāo)包括:溶液外觀、一般鹽類檢測、溶液pH值檢測、溶解情況檢測、干燥失重的檢測、熾灼殘渣等。

主要化學(xué)原材料的供應(yīng)商要求相對固定,不得隨意發(fā)生變更?;瘜W(xué)原材料在購入時,原材料的生產(chǎn)商必須提供該批次化學(xué)原材料的質(zhì)量質(zhì)量保證材料和質(zhì)量檢驗報告,其質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)應(yīng)達(dá)到生產(chǎn)所需的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)。

(1)無機(jī)類

主要包括氯化鈉、氫氧化鈉、純化水等。

(2)有機(jī)類

主要包括有丙酮、乙醇、枸櫞酸、吐溫20、乙二胺四乙酸二鈉、氨基吡啉等。

(3)特殊化學(xué)原料

DAB(聯(lián)苯二胺),染色劑等。

4、其他物料

(1)基質(zhì)

以硝酸纖維素膜為例:孔徑符合設(shè)計要求(0.45μm、0.22μm等)、均一性(厚度及毛細(xì)遷移速度±20%)、尺寸(與標(biāo)識吻合)

(2)瓶子和干燥劑

由生產(chǎn)廠家提供質(zhì)量保證,達(dá)到規(guī)定要求。

(3)其他:說明書、包裝外盒等

應(yīng)參照國家食品藥品監(jiān)督管理局頒布的《體外診斷試劑說明書編寫指導(dǎo)原則》和《醫(yī)療器械說明書、標(biāo)簽和包裝標(biāo)識管理規(guī)定》執(zhí)行。

三、試劑盒各組分的生產(chǎn)

生物芯片主要包括DNA芯片、蛋白芯片、組織芯片、細(xì)胞芯片以及芯片實驗室等。生物芯片診斷試劑產(chǎn)品基本可分成二個部分,一部分是芯片,另一部分檢測用工作液。如果有配套的檢測儀器,還需對儀器及處理軟件的應(yīng)用加以說明。

(一)芯片的生產(chǎn)

芯片生產(chǎn)的基本過程包括探針的獲取方法,純化,點(diǎn)樣,固定。

1、探針獲取

不同的芯片,主要是探針不同,生物芯片的探針主要包括以下幾類,其它探針可參考制定相應(yīng)的技術(shù)及質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)。

(1)DNA探針的獲取

探針的形式有PCR產(chǎn)物、克隆DNA、人工合成DNA片段等;要求有生產(chǎn)程序和質(zhì)量指標(biāo)及檢測方法,要進(jìn)行純化,有固定的純化程序。

(2)抗原的生產(chǎn)

抗原的獲得方法包括細(xì)胞培養(yǎng)、從生物材料中分離提取、基因工程表達(dá)以及合成肽等。基因工程表達(dá)產(chǎn)物又分為純抗原蛋白、融合蛋白等。

(3)抗體

抗體分單克隆抗體和多克隆抗體??贵w制備包括細(xì)胞培養(yǎng),動物腹水,基因工程表達(dá)等方式。

(4)細(xì)胞和組織

包括細(xì)胞或組織類型,固定方法。組織材料還包括固定,包埋,切片等。

(5)芯片實驗室,包括各種管道泵的制作等。

2、陣列的排列設(shè)計

陣列的排列包括依次排列、隨機(jī)排列、對角線排列等,設(shè)計時需考慮重復(fù)次數(shù)等。

3、點(diǎn)陣的制作

使用儀器的要確定型號,程序;手工制作的也要有標(biāo)準(zhǔn)操作程序。

4、固定:包括固定方式,固定的條件等。

應(yīng)對芯片生產(chǎn)的過程進(jìn)行相應(yīng)的質(zhì)量控制,如點(diǎn)樣和固定過程的監(jiān)控、點(diǎn)樣均一性檢驗等。

(二)工作液配制

1、芯片生產(chǎn)所需試劑,包括細(xì)胞培養(yǎng)基,探針制備試劑,陣列制作和固定試劑等。

2、樣品處理試劑,芯片檢測靶分子分為核酸和蛋白質(zhì)。檢測核酸的樣品處理試劑包括臨床取樣,DNA提取或RNA提取試劑,逆轉(zhuǎn)錄試劑,PCR擴(kuò)增試劑,核酸標(biāo)記試劑等;檢測蛋白的處理試劑包括取樣試劑,蛋白稀釋液以及特殊試劑等。

3、反應(yīng)液:檢測核酸時的反應(yīng)液包括預(yù)雜交液,雜交液,洗脫液等;檢測蛋白時,包括封閉液,抗原/抗體反應(yīng)液,洗脫液,顯色液,顯色終止液等。

(三)數(shù)據(jù)判讀

1、判斷標(biāo)準(zhǔn)及依據(jù),包括Cut off值的確定依據(jù)。 

2、數(shù)據(jù)判讀方式:人工還是軟件判讀。

3、如果是軟件判讀,應(yīng)提供軟件判斷的科學(xué)依據(jù)(包括生物學(xué)原理、數(shù)據(jù)獲取原理和判斷實驗是否成立的依據(jù))以及實驗測試的原始報告(或數(shù)據(jù)),并需要說明:

(1)軟件的來源:購買或自己編制,是否獲得注冊等。

(2)軟件的用途:包括對數(shù)據(jù)的分析、存儲、解讀、含義等。

(3)軟件的使用:基本的使用程序。

四、半成品質(zhì)量控制

(一)抽樣

檢驗人員按批號抽取檢定需要數(shù)量的半成品,作好標(biāo)記,待檢。

(二)質(zhì)控品 

可用克隆并測序鑒定的DNA或經(jīng)特異性鑒定的抗原(或抗體)。質(zhì)控品的基質(zhì)應(yīng)盡可能與被測物基質(zhì)相一致。

(三)檢定要求

1、芯片檢定

(1)靈敏度:最低檢測限達(dá)到規(guī)定要求。

(2)特異性:應(yīng)達(dá)到規(guī)定要求。若進(jìn)行全陰、全陽和交叉反應(yīng)檢測,全陰性檢測應(yīng)在沒有靶分子存在時,所有檢測位點(diǎn)沒有檢測信號;全陽性檢測應(yīng)在加入足夠量的靶分子,所有檢測位點(diǎn)均有檢測信號;交叉反應(yīng)檢測時,用某一位點(diǎn)的靶分子檢測,應(yīng)只有該位點(diǎn)有檢測信號,其它位點(diǎn)不能有檢測信號。

(3)精密性(均一性):用比最低檢測限高一個數(shù)量級的質(zhì)控品,重復(fù)檢測10次,判定結(jié)果一致。

考慮到芯片的多位點(diǎn)檢測,因此要進(jìn)行全位點(diǎn)和單個位點(diǎn)進(jìn)行檢測。半成品檢定可以用克隆DNA和鑒定的抗原和抗體作質(zhì)控品。

2、工作液的檢定

(1)物理檢測:外觀顏色正常,沒有雜質(zhì)。

(2)質(zhì)量檢定:用被檢定的工作液檢測標(biāo)準(zhǔn)樣,檢測結(jié)果達(dá)到預(yù)定要求。

五、成品質(zhì)量控制

(一)生產(chǎn)批量

申報生產(chǎn)的批量每批原則上不低于1000人份。

(二)抽樣

檢驗人員按批號抽取檢定需要數(shù)量的半成品,做好標(biāo)記,待檢。

(三)標(biāo)準(zhǔn)品(參考品)

應(yīng)用國家標(biāo)準(zhǔn)品或參考品進(jìn)行檢定,若無國家標(biāo)準(zhǔn)品(參考品),可以使用企業(yè)參考品,但其標(biāo)準(zhǔn)不得低于第一家已經(jīng)獲得批準(zhǔn)的該類試劑。

(四)檢定要求

1、靈敏度:應(yīng)達(dá)到規(guī)定要求。

2、特異性:應(yīng)達(dá)到規(guī)定要求。

3、精密性(均一性):對某一樣本,重復(fù)10次,對病種的定性檢測結(jié)果一致。

4、穩(wěn)定性(僅對蛋白芯片)

37℃放置至少3天,靈敏度、特異性和精密度仍達(dá)到規(guī)定要求。熱加速破壞試驗的時間長短,可由生產(chǎn)單位根據(jù)不同產(chǎn)品在37℃貯存與常溫貯存(2℃~8℃)中質(zhì)量變化的相關(guān)性來決定。

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